La ricerca didattica del Movimento di Cooperazione Educativa si esplica in varie forme in particolare attraverso alcuni Gruppi Nazionali che approfondiscono tematiche specifiche.
I gruppi attualmente in attività sono i seguenti:
- Scuola Interculturale di Formazione (SIF)
- Storia e territorio
- Pedagogia del cielo
- Gruppo Kore
- Gruppo Lingua
Il gruppo di Ricerca-formazione sulla valutazione delle competenze ha concluso il suo percorso e i materiali sono a disposizione degli interessati.